Historique
Périodique
Using phylogenetic analysis to trace HIV-1 migration among western European injecting drug users seroconverting from 1984 to 1997
(Utilisation de l'analyse phylogénétique pour suivre la migration du VIH-1 parmi les usagers de drogue injectable de l'Europe de l'ouest séroconvertis entre 1984 et 1997.)
Auteur(s) :
OP DE COUL, E. L. M. ;
PRINS, M. ;
CORNELISSEN, M. ;
VAN DER SCHOOT, A. ;
BOUFASSA, F. ;
BRETTLE, R. P. ;
HERNANDEZ-AGUADO, I. ;
SCHIFFER, V. ;
MCMENAMIN, J. ;
REZZA, G. ;
ROBERTSON, R. ;
ZANGERLE, R. ;
GOUDSMIT, J. ;
COUTINHO, R. A. ;
LUKASHOV, V. V.
Année
2001
Page(s) :
257-266
Langue(s) :
Anglais
Domaine :
Drogues illicites / Illicit drugs
Discipline :
MAL (Maladies infectieuses / Infectious diseases)
Thésaurus mots-clés
VIH
;
INJECTION
;
CONTAMINATION
;
EVOLUTION
;
GEOGRAPHIE
;
GENETIQUE
;
EPIDEMIOLOGIE DESCRIPTIVE
Thésaurus géographique
EUROPE DE L'OUEST
Note générale :
AIDS, 2001, 15, (2), 257-266
Résumé :
FRANÇAIS :
Des données épidémiologiques et des analyses phylogénétiques (séquence en V3) de 145 UDIs séroconvertis durant trois périodes (1984-1988, 1989-1992 et 1993-1997) ont été étudiées. Des sous populations génétiquement liées aux souches VIH ont été observées en Italie, France, Ecosse et Espagne. En revanche, elles n'ont pas été observées en Hollande, Italie, Autriche et Suisse. Cette différence entre les deux groupes de pays suggère que l'épidémie VIH dans le deuxième groupe de pays est due à la contamination par de multiples virus. A Edinbourg et dans ses environs, la plupart des UDVIs ont été contaminés par la même souche GGC sur les 12 années de l'étude. En Europe du Nord, l'épidémie a commencé par les virus GGC, tandis qu'en Europe du Sud, les virus non GGC ont prédominé.
ENGLISH:
Objective: To reconstruct the epidemiological relationships of the HIV epidemics among injecting drug users (IDU) in western Europe. Methods: HIV env V3 sequences of and epidemiological data were obtained from 145 IDU who seroconverted in three sequential periods: 1984-1988, 1989-1992 and 1993-1997. The sequences were phylogenetically analysed and examined for signature patterns characteristic of northern European IDU, including the conserved GGC codon in the V3 loop. Results: Subpopulations of genetically related HIV strains were observed in Italy, France, Scotland and Spain, in contrast to the Netherlands, Austria and Switzerland. This difference between the two groups of countries suggests that the HIV epidemics amongst IDU in the latter group was caused by multiple virus introductions. In Edinburgh and the surrounding area, most IDU were infected with the same GGC strain over the 12-year study period. The epidemic among IDU in north-western Europe started with GGC viruses, whereas in south-western Europe non-GGC viruses predominated. This geographical separation has faded during the course of the epidemic, most likely because of virus exchange among IDU populations. (Author' s abstract)
Des données épidémiologiques et des analyses phylogénétiques (séquence en V3) de 145 UDIs séroconvertis durant trois périodes (1984-1988, 1989-1992 et 1993-1997) ont été étudiées. Des sous populations génétiquement liées aux souches VIH ont été observées en Italie, France, Ecosse et Espagne. En revanche, elles n'ont pas été observées en Hollande, Italie, Autriche et Suisse. Cette différence entre les deux groupes de pays suggère que l'épidémie VIH dans le deuxième groupe de pays est due à la contamination par de multiples virus. A Edinbourg et dans ses environs, la plupart des UDVIs ont été contaminés par la même souche GGC sur les 12 années de l'étude. En Europe du Nord, l'épidémie a commencé par les virus GGC, tandis qu'en Europe du Sud, les virus non GGC ont prédominé.
ENGLISH:
Objective: To reconstruct the epidemiological relationships of the HIV epidemics among injecting drug users (IDU) in western Europe. Methods: HIV env V3 sequences of and epidemiological data were obtained from 145 IDU who seroconverted in three sequential periods: 1984-1988, 1989-1992 and 1993-1997. The sequences were phylogenetically analysed and examined for signature patterns characteristic of northern European IDU, including the conserved GGC codon in the V3 loop. Results: Subpopulations of genetically related HIV strains were observed in Italy, France, Scotland and Spain, in contrast to the Netherlands, Austria and Switzerland. This difference between the two groups of countries suggests that the HIV epidemics amongst IDU in the latter group was caused by multiple virus introductions. In Edinburgh and the surrounding area, most IDU were infected with the same GGC strain over the 12-year study period. The epidemic among IDU in north-western Europe started with GGC viruses, whereas in south-western Europe non-GGC viruses predominated. This geographical separation has faded during the course of the epidemic, most likely because of virus exchange among IDU populations. (Author' s abstract)
Affiliation :
Div. Public Hlth Environm., Municipal Hlth Serv., Nieuwe Achtergracht 100, 1018 WT Amsterdam
Pays-Bas. Netherlands.
Pays-Bas. Netherlands.